圖論在RNA二級結構中的應用

圖論是以圖為研究對象的數學分支,是一門研究事物對象在圖表示法中的特征與性質的學科.鑒于RNA二級結構在功能基因組研究中的重要地位,已發展了用二維圖解表示法描述RNA二級結構.文章介紹了用于RNA二級結構圖解表示法的兩種圖,即樹圖和對偶圖的構造規則.并在樹圖表示基礎上產生Laplacian矩陣和相應本征值譜.以有害突變預測和類RNA模體設計的例子,說明圖論在RNA二級結構中的應用,同時對可能存在的一些問題做了討論.

作 者： 周文彥 曹槐 ZHOU Wen-yan CAO Huai   作者單位： 云南大學現代生物學研究中心,昆明,650091  刊 名： 生物信息學  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分類號： Q111  關鍵詞： 圖論   RNA二級結構   樹圖   對偶圖   Laplacian矩陣本征值  

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